Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGTPBP1Q9UPW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGTPBP1Q9UPW5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms