Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN3Q9UPQ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms