Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms