Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms