Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDRG4Q9ULP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms