Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF608Q9ULD9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF608Q9ULD9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF608Q9ULD9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms