Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH7Q9ULB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH7Q9ULB5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms