Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA3Q9UL41 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms