Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA11Q9UKX5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms