Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN3Q9UKA8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN3Q9UKA8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms