Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBE1Q9UJT0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms