Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACL1Q9UJ83 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms