Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms