Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MLH3Q9UHC1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms