Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA9Q9UGM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms