Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF2Q9UG63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms