Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms