Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms