Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
REREQ9P2R6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms