Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP35Q9P2H5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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