Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms