Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNRD1Q9P1U0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms