Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20BQ9P0W2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms