Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC59Q9P031 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms