Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF12Q9NZN5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF12Q9NZN5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms