Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms