Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A4Q9NY91 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms