Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CWC25Q9NXE8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms