Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms