Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms