Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLIMQ9NVW2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLIMQ9NVW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLIMQ9NVW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLIMQ9NVW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms