Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms