Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms