Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SALL1Q9NSC2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms