Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms