Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN4Q9NRL3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms