Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM10Q9NQV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM10Q9NQV6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms