Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INCENPQ9NQS7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms