Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms