Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA4BQ9NPR2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms