Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms