Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUFT1Q9NNX1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms