Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms