Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC90BQ9GZT6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms