Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BCL11BQ9C0K0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCL11BQ9C0K0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms