Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms