Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 397 ms