Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms