Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms