Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms